El municipio lleva el nombre del General Salvador Alvarado Rubio (1880-1924) destacado revolucionario sinaloense y miembro del Partido Liberal Mexicano. Durante la Epoca Prehispánica esta región fue un centro comercial náhuatl, posteriormente de 1564-1584 fue destruida durante la conquista española quedando totalmente despoblada.
En 1699 llegó a la región el Capitán Manuel Gómez Maldonado, el primer propietario del predio de San Pedro de Guamúchil. Diez anos más tarde Sebastián López Ayala y Gúzman se dedico a la explotación de las tierras y en 1750 el poblado de Ciénega se anexo a San Pedro de Guamúchil, territorio que fue donado por Manuel Montoya. No fue hasta el 22 de Febrero de 1962 cuando el municipio de Salvador Alvarado se separa de Culiacán para formar el 17o municipio del estado.
En 1699 llegó a la región el Capitán Manuel Gómez Maldonado, el primer propietario del predio de San Pedro de Guamúchil. Diez anos más tarde Sebastián López Ayala y Gúzman se dedico a la explotación de las tierras y en 1750 el poblado de Ciénega se anexo a San Pedro de Guamúchil, territorio que fue donado por Manuel Montoya. No fue hasta el 22 de Febrero de 1962 cuando el municipio de Salvador Alvarado se separa de Culiacán para formar el 17o municipio del estado.